Aspergillus salvadorensis sp. nov.
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Date
2025-11-03
Authors
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Publisher
Universidad de El Salvador. Facultad de Medicina
Abstract
El estudio se centró en la identificación integral de una muestra de Aspergillus, que se envió a MACROGEN SOUTH KOREA Illumina NovaSeq 6000 2024 para su análisis. La identificación se logró combinando la caracterización de sus metabolitos secundarios y rasgos morfológicos (análisis fenotípico) con técnicas avanzadas de ADN molecular (análisis genotípico), es-pecíficamente a través del método Next-Generation Sequencing (NGS). El objetivo principal fue realizar la caracterización fenotípica y genotípica del género Aspergillus utilizando el método de secuenciación de próxima generación (NGS). El estu-dio empleó una metodología exploratoria y experimental, llevada a cabo en dos fases históricas principales. La fase inicial consistió en la recolección de semillas de Caesalpinia coriaria. La segunda fase comenzó en 2006 con la caracterización y aislamiento macroscópico y microscópico inicial de Aspergillus. A esto le siguió un acta notarial en 2007, y en 2008 se realiza-ron estudios de microscopía electrónica simple y de barrido, junto con PCR del hongo, en México y se publicaron en la re-vista La Universidad. Más recientemente, en 2024, se realizó la extracción de ADN genómico (ADNg), la qPCR y la prepara-ción de ADNc en MACROGEN INC. para Metagenome Shotgun Sequencing Reports.Los resultados demostraron datos moleculares de alta calidad. Se extrajo el ADNg, obteniendo una concentración máxima de 12.297 ng/μl (con un volumen de 30 μl y una cantidad total de 0.369 ng), y un Número de Integridad del ADN (DIN) de 6.4. La intensidad máxima de la mues-tra se observó para 15000 pb durante el control de calidad de la pantalla de ADNg de TapeStation. El análisis de qPCR mostró un fragmento de qDNA de 624 pb a una concentración de 103,24 nM (41,87 ng/μl). Para el proceso de secuenciación, se obtu-vieron un total de 11.705.895.990 pb y 77.522.490 lecturas totales utilizando la biblioteca TruSeq Nano DNA. El contenido de nucleótidos fue de 49,7% GC y 50,3% AT. Las métricas de calidad fueron excelentes, con Q20 en 95.1% y Q30 en 88.3%, lo que confirma la alta calidad de los datos. Después del recorte de calidad y adaptador, y la eliminación de contaminantes, el valor de los datos brutos se refinó de 38,761,245 N a 30,961,740. La taxonomía de Krona y los mapas de calor confirmaron que el género es Aspergillus. En conclusión, el hongo posee varias vías metabólicas activas únicas que le permiten producir tintes es-pecíficos. Esta capacidad distintiva, que puede ser el resultado de la evolución local en respuesta a condiciones ambientales particulares, podría justificar su clasificación como una nueva especie. El Aspergillus sp se identificó con éxito utilizando el método de secuenciación NGS, mostrando una variedad de especies, lo que se alinea con estudios previos en 2006 donde se denominó Aspergillus salvadorensis.
Description
Keywords
Aspergillus sp, Nacascol, salvadorensis, Caeselpinia coriaria