Publication: Evaluación de la diversidad genética en poblaciones de anona (Annona macroprophyllata Donn.Sm.) procedentes de cuatro departamentos de El Salvador, usando marcadores SCoT
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Date
2025
Authors
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Publisher
Universidad de El Salvador. Facultad de Ciencias Agronómicas
Abstract
La anona (Annona macroprophyllata) es la especie de la familia anonaceae más relevante a nivel comercial en El Salvador debido a sus frutos dulces comestibles; sin embargo, no se cuentan con registros previos de estudios de diversidad genética con marcadores moleculares en estas poblaciones. Los marcadores SCoT (Start Codon Targeted Polymorphism) constituyen un importante grupo de marcadores PCR (Reacción en cadena de la polimerasa) dominantes para revelar entre otros indicadores, polimorfismos en diferentes especies de plantas. En el presente estudio se analizó la diversidad genética de 40 individuos de A. macroprophyllata procedentes de cuatro departamentos de El Salvador, con 7 cebadores SCoT. El ADN de los individuos fue extraído con un kit comercial Analytik Jena®. Se desarrolló un protocolo de extracción y evaluación de la cantidad e integridad de ADN de esta especie. Los resultados de amplificación se trasladaron a una matriz básica de datos binaria, a partir de la cual se realizó un análisis de agrupamiento UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean), y se utilizó el coeficiente de similaridad de Jaccard, acompañado de un análisis de coordenadas principales (PCoA). Por cada cebador, se calcularon parámetros de informatividad y diversidad genética. Se calculó el porcentaje de polimorfismo (%P), contenido de información polimórfica (PIC), el índice del marcador (IM), el Poder de Resolución (Rp), la Heterocigocidad esperada (He) y el Número de alelos efectivos (Ne). Además, por cada sitio de colecta (población), se calculó el %P, He y Ne. Los productos de amplificación se encontraron en un intervalo entre 400-3000 pb. El %P fue del 100% con todos los cebadores utilizados. El promedio de PIC fue de 0.43, considerado altamente informativo. El promedio de He por cebador fue de 0.41 y de Ne fue de 1.72. Los análisis UPGMA y PCoA distribuyeron los individuos conforme su ubicación geográfica, en cuatro grandes grupos. Este es el primer estudio de diversidad genética con marcadores moleculares de A. macroprophyllata en poblaciones de El Salvador.
Description
Keywords
Annona, Genética molecular