Metabolitos secundarios Clusters en el ADN y su caracterización fenotípica y genotípica de Aspergillus salvadorensis en semillas de Nacascol. El Salvador. 2006/2024
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Date
2026-03-03
Authors
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Publisher
IKR
Abstract
Los metabolitos secundarios y las técnicas de ADN molecular de estudios fenotípico y genotipico permitieron la identifi-cación de la muestra de Aspergillus enviada a MACROGEN SOUTH KOREA. Objetivo: Realizar la caracterización fenotípica y genotípica del género Aspergillus mediante el método de secuenciación de nueva generación (NGS). Metodología: El tipo de estudio es exploratorio y experimental. Se realizó en dos fases: primero en la recolección de semillas de Caesalpinia coriaria y segundo se realizó una caracterización macroscópica y microscópica inicial del aislamiento de Aspergillus en 2006, se realizó un acta notarial en 2007, estudios de microscopía simple y microscopía electrónica de barrido y PCR del hongo encontrado en México 2008 y publicado en la revista La Universidad en 2008, luego la extracción de ADNg, qPCR, ADNc se realizó en 2024 en MACROGEN INC. por Metagenome Shotgun Sequencing Reports. Resultados: Se extrajo el genoma del ADNg ob-teniendo una concentración máxima de 12.297 ng/ul, volumen 30 ul, cantidad total 0.369 y DIN 6.4 nivel máximo 8732 inten-sidad de muestra para 15000 pb, el qDNA cuántico se obtuvo a 624 pb a una concentración de 103.24 nM y 41.87 ng/ul y ADNc. A partir de la extracción de ADNg del TapeStation gDNA Screen, se obtuvo una concentración máxima de 12.297 ng/ul, volumen 30 ul, cantidad total 0.369 y DIN 6.4 nivel máximo 8732 intensidad de muestra para 15000 pb en control de calidad. Se obtuvieron qPCR 624 pb a una concentración de 103,24 nM y 41,87 ng/ul con la biblioteca de ADN TruSeq Nano (350_META). Se utilizaron 33 kits de biblioteca de ADNc. El total, de bases obtenidas fueron 11.705.895.990 pb, el total, de lecturas fueron 77.522.490. Contenido de nucleótidos de GC % 49.7 y AT % 50.30, el contenido de base de GC fue 49.7% y AT fue 50.3, contenido de base métrica Q 20: 95.1 y Q 30: 88.3, calidad de datos del ciclo Q30 de alto valor. Se utilizaron los forma-tos FASTQ y FASTA para la codificación y secuenciación completa de pares de bases. Valor de datos sin procesar. 38.761.245 N, calidad del adaptador y recorte. (Calidad y ajuste del adaptador.) fue de 32.535.420, la eliminación de contaminantes fue de 30.961.740. A partir de la taxonomía Krona, se informó de Aspergillus variedades de especies. Conclusiones: Tiene varias vías metabólicas únicas que le permite producir colorantes específicos, esto sería una característica que podría justificar su clasificación como una nueva especie, ya que esta habilidad podría ser el resultado de una evolución local en respuesta a condiciones ambientales particulares. En estudios previos en 2006 se denominó la especie salvadorensis. Se encontraron 14 enzimas y metabolitos secundarios en la producción de pigmentos negros producidos por el hongo por estrés oxidativo.
Description
Keywords
Aspergillus sp, Nacascol, salvadorensis, estrés oxidativo