Prevalencia de metabolitos secundarios diana clústeres cancerígenos en la secuencia DNA circular de Aspergillus salvadorensis a Aflatoxinas.
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Date
2026-03-03
Authors
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IKR Microbiology
Abstract
Objetivo. Determinar la prevalencia de genes precursores clústeres de cáncer en la especie A. salvadorensis, utilizando la base de datos secuenciada por MACROGEN INC Kore del Sur por el método la secuenciación de DNA circular por Illumina del método Metagenome Shotgun Sequencing (NGS) diseño de 67M spots, 9.9G bases y 4.3Gb. Utilizó el siguiente método: MetaPhlAn4, en donde se recopiló toda la información genética que puedan tener los microorganismos identificados a través de una base de datos validada y para los genes que no están en la base de datos se tradujo en secuencias de proteínas y se comparan con una base de datos de proteínas como UniRef90, aunque no identifican moléculas anticancerígenas solamente los genes precursores esto se hace por métodos de laboratorio como HPLC o ELISA. La investigación es un diseño descriptivo de corte transversal con un nivel alfa 0.005%. llevándose a cabo en los laboratorios de microbiología de la Facultad de Medicina y en MACROGEN INC de Korea del Sur. Se utilizaron programas de bioinformática BLAST, CLUSTAL, GENBANK, M11, UGENE, T-COFEE incluyendo PHYTON. No se utilizarán sujetos humanos en la investigación. Los lotes de semillas fueron sometidos a un análisis de luz ultravioleta (UV), Este método cualitativo de laboratorio, simple y rápido sirvió como una primera aproximación para identificar la posible presencia de Aflatoxinas que luego se confirmó con el análisis de genes en la secuenciación. El análisis se centró en la búsqueda de genes clave dentro del clúster de aflatoxinas, como aflC, aflD, aflR y aflS. Conclusiones. En nuestro estudio la prevalencia en la cadena DNA circular positiva a aflatoxinas fue negativa y si es negativa la prevalencia seria de cero. El uso de luz ultravioleta para determinar aflatoxinas es sugestivo para encontrar en cantidades suficientes presentes en las semillas, posible se utilice como para identificar contaminantes a hongos. De las especies más comunes del género Aspegillus que producen aflatoxinas, están: A. flavus, A. pararasiticus, A. nomius, A. ochraceus, A. wentii en condiciones óptimas de temperatura y humedad. La especie A. salvadorensis no tiene capacidad para producir aflatoxinas en dosis toxica y no presenta aflatoxinas cancerígenas según reporte de Macrogen Inc “gene family UniRef90_M2YIY2: Dothistromin biosynthesis regulatory protein aflR, UniRef90_O42716: Aflatoxin cluster transcriptional coactivator aflS genes related to aflatoxin were not detected”.
Description
Keywords
Aspergillus sp, aflatoxinas, luz ultravioleta, bioinformática